Bei der Herstellung von Greyerzer AOP wird zunächst die Rohmilch im traditionellen Kupferkessel mit Lab versetzt. Das Milcheiweiß dickt dadurch ein und die sogenannte Dickete entsteht. Diese wird mit einer Käseharfe zerschnitten und erst dann erhitzt. Die feste Masse, Käsebruch genannt, kann so den gesamten Geschmack der gehaltvollen Alpmilch behalten. Käsebruch und Molke werden in Formen gefüllt und rund 20 Stunden lang gepresst. Die Käselaibe werden im nächsten Schritt in Salzlake gelegt und danach zur Reifung in ein Lager gebracht.
Dort herrscht eine Luftfeuchtigkeit von rund 95% und eine Temperatur zwischen 13 und 14°C; die idealen Bedingungen zur Entfaltung der Aromen und einer leicht feuchten Rinde. Bei höherer Feuchtigkeit wird die Rinde schmierig, bei geringerer der Käselaib trocken und bröckelig. Die Reifung dauert die erwähnten 5 bis 15 Monate, wobei sich bei längerer Reifezeit Salzkristalle im Käse bilden und das Milcheiweiß abgebaut wird, sodass er laktosefrei ist.